巧克力囊肿，又称子宫内膜异位囊肿，是一种常见的妇科疾病。对于患有巧克力囊肿的女性来说，若想要通过试管婴儿技术怀孕，选择一家专业、设备先进的医院至关重要。那么，巧克力囊肿患者在何处进行第三代试管婴儿手术呢？

首先，第三代试管婴儿技术，也称为胚胎植入前遗传学诊断（PGD），是一种在胚胎移植前对胚胎进行遗传学检测的技术。这项技术可以帮助患有遗传性疾病或染色体异常的患者，提高试管婴儿成功率。对于患有巧克力囊肿的女性，若想进行第三代试管婴儿手术，以下是一些推荐的医院：

1. 北京大学第三医院生殖医学中心

北京大学第三医院生殖医学中心是国内最早开展试管婴儿技术的医院之一，拥有丰富的临床经验和先进的设备。该中心在第三代试管婴儿技术方面也有着较高的水平，可以为患有巧克力囊肿的女性提供专业的诊疗服务。

2. 上海交通大学医学院附属仁济医院生殖医学中心

仁济医院生殖医学中心是国内领先的生殖医学中心之一，拥有先进的试管婴儿技术和设备。该中心在第三代试管婴儿技术方面也有着丰富的经验，可以为患有巧克力囊肿的女性提供专业的诊疗服务。

3. 广州医科大学附属第一医院生殖医学中心

广州医科大学附属第一医院生殖医学中心是国内较早开展试管婴儿技术的医院之一，拥有丰富的临床经验和先进的设备。该中心在第三代试管婴儿技术方面也有着较高的水平，可以为患有巧克力囊肿的女性提供专业的诊疗服务。

4. 浙江大学医学院附属妇产科医院生殖医学中心

浙江大学医学院附属妇产科医院生殖医学中心是国内领先的生殖医学中心之一，拥有先进的试管婴儿技术和设备。该中心在第三代试管婴儿技术方面也有着丰富的经验，可以为患有巧克力囊肿的女性提供专业的诊疗服务。

在选择医院时，以下因素需要考虑：

1. 医院口碑：了解医院在试管婴儿技术方面的口碑，可以参考患者评价、媒体报道等。

2. 医疗团队：了解医院生殖医学中心的医生团队，包括医生的专业背景、经验等。

3. 设备水平：了解医院的试管婴儿设备水平，包括实验室设备、手术室设备等。

4. 成功率：了解医院在第三代试管婴儿技术方面的成功率，以及针对巧克力囊肿患者的成功率。

总之，巧克力囊肿患者在选择进行第三代试管婴儿手术的医院时，应综合考虑医院口碑、医疗团队、设备水平和成功率等因素。通过以上推荐，希望对患有巧克力囊肿的女性有所帮助。在治疗过程中，患者还需保持良好的心态，积极配合医生的治疗方案，以提高试管婴儿成功率。